Ермекеевский район расположен в западной части Республики Башкортостан. Ермекеевский район граничит на западе с Оренбургской областью и Республикой Татарстан, на севере – с Туймазинским, на востоке – с Белебеевским и на юге – с Бижбулякским районами республики. Районный центр – село Ермекеево находится от столицы республики города Уфы на расстоянии 235 км.
Административно район разделен на 17 сельских поселений, имеется 51 населенный пункт.